Od wersji 3.89 wprowadzono mechanizm zabezpieczający przed wysyłką tych samych dokumentów do KSeF przez więcej niż jednego operatora, co zapobiega dublowaniu faktur na serwerach Ministerstwa Finansów.
W sytuacji, gdy dokumenty są już wysyłane przez jednego operatora, a inny operator podejmie próbę wysyłki tych samych dokumentów, system zablokuje tę operację i wyświetli stosowny komunikat informujący o uniemożliwieniu wysyłki.
