Istnieje również możliwość tworzenia faktur wewnętrznych jako pojedynczych dokumentów, mogących pojawić się w rejestrze VAT zarówno po stronie sprzedaży, jak i zakupów. Dokumenty te zostały oznaczone jako:
- WF – faktury wewnętrzne,
- WK – faktury wewnętrzne – korekty.
Użycie faktur wewnętrznych uzależnione jest od parametru Faktury wewnętrzne, znajdującego się w ustawieniach globalnych programu.
Domyślnym ustawieniem jest para dokumentów – sprzedaży i zakupu. Faktury wewnętrzne wystawiane są tak jak dotychczas. Ustawienie dokumenty WF powoduje włączenie drugiego sposobu obsługi faktur wewnętrznych. W menu sprzedaży dostępne są wtedy opcje Faktury wewnętrzne i Korekty faktur wewnętrznych. Dokumenty mogą być wystawiane ręcznie, lub też generowane z dokumentów faktur importowych i ich korekt.
⇒ Patrz rozdział: Zakupy -> Faktury importowe (FI)
Podczas generowania dostępne są podobne ustawienia jak dotychczas. Różnice są dwie – do wyboru jest tylko jeden rodzaj dokumentów – WF (lub odpowiednio WK) i na formularzu znajduje się znacznik Przenieś do rejestru VAT zakupu.
W danych księgowych dla dokumentów WF i WK osobno można zdecydować o dacie wejścia dokumentu do rejestru VAT sprzedaży i zakupu.
Wystawiając ręcznie fakturę wewnętrzną lub korektę powołujemy się na dokument źródłowy (FI lub KI). Przy przejściu do pozycji dokumentu program zapyta wtedy, czy wygenerować pozycje na podstawie dokumentu źródłowego. Pytanie zadawane jest każdorazowo, jeśli tylko faktura wewnętrzna lub korekta nie posiadają pozycji. Można więc wygenerować pozycje na podstawie dokumentu źródłowego, lub też dodać je ręcznie. Jeżeli nie podamy dokumentu źródłowego, pozycje faktury wewnętrznej lub korekty nie będą mogły zostać wygenerowane.
Faktury wewnętrzne i korekty umożliwiają edycję podsumowania (tak, jak faktury zakupu). Możliwa jest ręczna zmiana wartości wynikowych faktur.
W rejestrze VAT oraz w podsumowaniu VAT (deklaracja VAT – 7) brane są pod uwagę zarówno stare, jak i nowe faktury wewnętrzne, niezależnie od ustawień globalnych. Umożliwia to płynne przejście z jednego sposobu wystawiania dokumentów w drugi, jak również chwilową zmianę w sytuacjach awaryjnych.