W opcji synchronizacja administrator portalu pracowniczego synchronizuje tematy zgłoszeń wraz z ich kolorami wybranymi konfiguratorze PP. Synchronizuje wszystkich pracowników dodanych w konfiguratorze programu HermesSQL/Corax. Synchronizuje konfigurację pracowników istniejących w portalu. Pracownicy nie istniejący w bazie otrzymają na skrzynkę email login i hasło do logowania na portalu. Synchronizuje wnioski urlopowe według aktualnego stanu w Hermesie. Należy wykonać synchronizację wniosków przed pierwszym uruchomieniem Portalu Pracowniczego.
Jeśli wnioski urlopowe zostały dodane po stronie Hermesa, żeby ukazały się na portalu konieczne jest wykonanie synchronizacji. Wnioski które zostały dodane po stronie portalu automatycznie synchronizują się z HermesemSQL/Coraxem i są widoczne na liście wniosków jak również w kartach pracy i w kalendarzu.